【手法】GIS（地理情報システム）
【手法】3Dモデル作成（SfM-MVS処理）で紹介したオルソ画像・DSMをGISを使って解析します。
モニタリング結果の可視化や効率的なデータ管理には、GISが最適なツールです。
一昔前は数百万円する業務ソフトもオープンソースの波によって、無償で使用できるソフト「QGIS」が登場しました。
登場当時はいろいろと不便なところもありましたが、最新版では問題なく使えます。
QGISは http://qgis.org/ja/site/ から日本語版をダウンロードできます。
Windows以外にも対応しています。
ここでは、QGIS（バージョン2.18.1）を用いたメッシュ解析を紹介します。
１） メッシュ作成
空撮画像は高解像度なデータが取得できるため、モニタリング結果は数cm単位で求めることができます。しかし、現場では詳細すぎる情報は役に立たないこともあります（木を見て，森を見ずになってはいけません）。私の圃場では、５m×５mのメッシュを設定し、メッシュ内に含まれるピクセルの平均値をメッシュ代表値として生産管理に活かしています。
メッシュ作成
※QGIS→Vector grid
不必要なメッシュは削除していきます。また、メッシュを回転させて、圃場と一致するように調整します。
圃場の形に合わせた５mメッシュ
※圃場が広大な場合やその他のメッシュデータを組み合わせたい場合には、JIS規格で決められた標準地域メッシュを使うと便利です。
２） NDVI（植生指標）
QGIS→ラスタ計算機で演算ができます。
NDVI = （近赤外画像 - 赤（可視光）画像） / （近赤外画像 + 赤（可視光）画像）
※センサ 可視光をRicho GR、近赤外をCanon S110（近赤外の波長帯を撮影できるように改造）でそれぞれ空撮を実施。
本来なら、放射輝度に変換しないといけませんが、ここでは近似値的にDN（Digital Number）値で計算しています。
NDVI（2016年７月21日）
赤色ほど植生の活性が高く、反対に青色は植生の活性が低い状態を示します
３） メッシュ統計
QGIS→地域統計でメッシュ統計を行います。
※メッシュ内の平均値、最大値、最小値、個数、標準偏差などが計算できます。
計算はボタンを押すだけです。計算後、レイヤを選択して、色を割り当てます。地図は、色彩次第で解析結果の印象も変わるので、適切な色合いを選択するようにしましょう。
NDVIメッシュ（2016年７月21日）
QGISが苦手だった鳥瞰図（３D表示）もプラグインを用いることで、下図のように表示できるようになりました。HTML形式で出力されます。
NDVIの鳥瞰図（2016年７月21日）